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Modules

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Gestion d'environnement d'applications et de librairies

Commandes

Taper "module help" pour l'ensemble des options de la commande module

  • module avail : lister les modules disponibles
  • module avail nom_appli : lister les modules disponibles pour l'application indiquée
  • module help nom_appli/version : afficher l'aide en ligne (si présente) pour l'application indiquée
  • module load nom_appli/version : charger l'environnement du module indiqué
  • module unload nom_appli/version : décharger l'environnement du module indiqué
  • module list : lister les environnements chargés

Cas des librairies

Le chargement d'un module de librairie (exemple ci-dessous pour FFTW 3.3.3 / Intel MPI) permet de compiler sans appliquer d'options "-I ..." ni "-L ..." relatives à la librairie en question dans un Makefile, si le compilateur Intel est utilisé. Le même Makefile peut alors être employé sur plusieurs centres de calcul ayant mis en place un module pour la librairie en question.

Les modules mis en place sur Antares ne s'appliquent pas au compilateur Gnu. Pour ce compilateur, les options "-I ..." ni "-L ..." relatives à une librairie doivent être appliquées par l'utilisateur.

Dans l'exemple de FFTW 3.3.3 pour Intel MPI, si le compilateur Gnu est appliqué, l'utilisateur doit donc utiliser les options "-I/soft/library/fftw3.3.3/impi/include" et "-L/soft/library/fftw3.3.3/impi/lib -lfftw3_mpi -lfftw3" dans son Makefile (options obtenues par la commande module display fftw/3.3.3/impi).

Pour la structure générale de fichiers Makefile, des exemples figurent dans le répertoire /soft/makefiles .

Exemples

Application Castem

login@antares-adm:~ module avail castem

------------------------------------------------- /soft/Modules/Antares_modules/cfd_fem_meshing --------------------------------------

castem/2013 castem/2014

login@antares-adm:~: module load castem/2013

Cast3m 2013 environment

Application Paraview

login@antares-adm:~ module help paraview/4.1.0_Parallel

----------- Module Specific Help for 'paraview/4.1.0_Parallel' ---------------------------

For visualization jobs, a documentation is available : http://www.crihan.fr/calcul/tech/documentation-ibm-cluster-idataplex-antares/visualisation-a-distance

Librairie FFTW

login@antares-adm:~ module avail fftw

------------------------------------------------- /soft/Modules/Antares_modules/libraries --------------------------------------------------

fftw/3.3.2/impi fftw/3.3.2/ompi fftw/3.3.3/impi fftw/3.3.3/ompi

login@antares-adm:~: module whatis fftw/3.3.3/impi

fftw/3.3.3/impi environment

fftw/3.3.3/impi : fftw 3.3.3 / Intel MPI / ifort - icc - icpc

login@antares-adm:~: module load fftw/3.3.3/impi

fftw/3.3.3/impi environment



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