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Documentation IBM cluster iDataPlex - ANTARES

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Documentation utilisateur : configuration, connexion et espace de travail, compilation et librairies, soumission des travaux, parallélisme

Synthèse : documentation simplifiée du calculateur Antares
Les commandes et informations pour une connexion rapide au cluster Antares à destination des utilisateurs familiers aux environnements de calcul. Pour une description détaillée se référer à la documentation complète.
Description de la configuration
Configuration matérielle et logicielle de la grappe de calcul ANTARES
Connexion et espace de travail
Connexion sur les frontales, espace de travail et quotas disque, environnement Shell sur ANTARES
Environnement de compilation et librairies
Ce document fournit les Informations nécessaires à la compilation d'un code : exemples de Makefile, utilisation de l'une ou l'autre des librairies MPI (Intel MPI, Open MPI), support de la norme MPI-3, options du compilateur Intel, utilisation des librairies mathématiques (MKL, FFTW) et des librairies de format de données (NETCDF, HDF5).
Soumission des travaux
Ce document décrit l'utilisation du logiciel de soumission des travaux (LoadLeveler) sur ANTARES : scripts de soumission pour différents types de travaux (séquentiels, OpenMP, MPI, hybrides MPI/OpenMP, accélérés sur GPU, CFD, chimie quantique, dynamique moléculaire, visualisation), classes de soumission, commandes utiles, bonnes pratiques et gestion des ressources demandées. Le mode interactif de mise au point est également décrit.
GPGPU
Accélération de codes sur processeur graphique (GPU)
Visualisation à distance
Service de visualisation des données à distance permettant les pré et post-traitements au moyen de logiciels graphiques.
Modules
Gestion d'environnement d'applications et de librairies
Supports de formation
Support des formations (utilisation d'Antares, calcul parallèle)
Portail calcul
Comptabilité d'heures.CPU par projet scientifique, supervision de la grappe de calcul ANTARES
Cluster Antares
 
Mises à jour d'Août 2013
Ce qui change : il faut parfois recompiler son application.
Demande d'assistance
Assistance technique du CRIHAN.

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